黑龙江民族职业学院设有以下专业教学系部及辅助机构：

    食品工程系

生物科技系

经济管理系

民族语言与教育系

艺术体育与传媒系

装备制造工程系

民族预科部

基础部

思想政治论理课教学教研部

继续教育中心

文献信息与网络中心