中，南，北，东，学校现有经济、法、教育、文、历史、理、工、农、医、管理、艺术等11大学科门类。拥有8个一级学科博士学位授权点，26个一级学科硕士学位授权点，16种硕士专业学位授权类型，92个本科专业，3个博士后流动站（科研工作站）。现有国家一流建设学科1个，国家级重点(培育)学科2个，自治区重点学科10个。

南区 北区 中区 东区，东区在北区的东面，四个区想通的，南区是医学院药学院，信科。东区主要是艺术类，中区是理学院外语学院，北区文学院

石河子大学有四个校区，分别是东区，中区，北区，南区，现在这两年新建好的有北北区（在北区的北边）

石河子大学分为中校区，北校区，南校区，东校区，药学院，医学院位于南校区，经管学院和文学院位于东校区