水产学院的前身是组建于1998年7月的日照职业技术学院水产系,现设有水产养殖技术、环境监测与治理技术、环境监测与评价、海洋化工生产技术四个专业,其中:

水产养殖技术专业2001年11月列为国家级试点专业,2006年评为山东省特色专业,2008年入选国家示范性院校建设专业;

环境监测与治理技术专业2004年与日照市环保局达成全面共建协议,并设有环境监测-工业分析方向单独招生,2011年成功申报了中央财政重点支持的提升产业服务能力的高职专业。

海洋化工生产技术专业为2011年新增专业。

另外,水产学院还设有:海洋生物工程技术中心、水产养殖训练中心、日照职业技术学院水产实习基地等组成部分。