重庆医科大学基础医学院(原基础医学部)建于1956年,由上海第一医学院(现复旦大学上海医学院)抽调100多名基础医学师资组建了重庆医学院基础医学部,1996年基础医学部更名为基础医学院。学院历经50余年的建设与发展,在师资队伍建设、教学改革、科学研究、学科建设、人才培养、对外交流等方面均取得了长足发展,并跃入全国基础医学先进行列。